Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms