Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF1Q3BBV0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms