Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms