Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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