Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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