Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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