Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms