Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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