Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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