Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms