Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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