Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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