Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CNGA3Q16281 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CNGA3Q16281 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CNGA3Q16281 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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