Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA2Q15822 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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