Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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NCOA1Q15788 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA1Q15788 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
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