Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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