Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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