Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1D2Q14995 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms