Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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