Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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GPNMBQ14956 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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