Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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