Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms