Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms