Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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