Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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