Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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