Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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