Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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