Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms