Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NR5A1Q13285 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR5A1Q13285 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms