Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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