Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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