Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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NR1H3Q13133 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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