Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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