Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms