Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms