Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms