Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms