Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms