Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms