Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms