Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms