Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB1P82279 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms