Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCDC1P59894 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms