Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms