Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT8P50990 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT8P50990 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT8P50990 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT8P50990 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT8P50990 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT8P50990 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT8P50990 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8P50990 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8P50990 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms