Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERFP50548 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERFP50548 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERFP50548 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERFP50548 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms