Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP5P45974 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP5P45974 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP5P45974 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP5P45974 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms