Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX5P45973 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX5P45973 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX5P45973 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX5P45973 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX5P45973 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX5P45973 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms