Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms